Berdasarkan visi dan misi MGMP IPA SMP Gunungkidul, dirumuskanlah program kerja komunitas yang berbasis kompetensi guru. Berikut deskripsi program kerjanya:
Catatan :
Selain program peningkatan kompetensi guru, mgmp juga memprogramkan program penguatan komunitas MGMP IPA SMP Gunungkidul sebagai sebuah organisasi
MGMP IPA SMP Gunungkidul dalam pelaksanaan program kerja berkolaborasi dengan Kemendikdasmen, Dinas Pendidikan tingkat Propinsi DIY atau Kabupaten/kota lain, BBGTK DIY, serta instansi lain yang tidak dapat disebutkan satu persatu